苍术种苗虽耐寒性较强，可以田间越冬，但北方的冬季比较寒冷，如果管理不当会遭受冻害，所以在越冬前需做好一些田间管理。
一、苍术地上部分枯萎后，挖起根茎，剪去茎蒂及须根，剔除病株，置于室内通气阴凉处摊晾3-5天，然后置于阴凉干燥室内。
二、在地面上先铺1层清洁的3-5厘米厚的砂，整齐放上种苗，厚约15厘米，盖上1层薄砂，再铺种苗，如此层层堆放，高不超过50厘米为宜。最后盖上5-10厘米厚细砂。
三、堆积前，按照种苗一定级别，分别堆放，以利分别移栽和堆积过程中经常检查。如果堆积面积过大，可在堆中间插上几束草把，通气散热，防止种苗霉烂。
四、苍术种苗耐寒性较强，可以田间越冬。越冬前，应清除地上部分残枝落叶和杂草，适当培土，保护根芽。翌年2月下旬，种芽开始萌动。
五、内蒙古东部区一般在自然越冬后，外界耕作层土壤温度达到5—10℃可移栽，一般4—6月进行，起苗后立即移栽。挖出种苗，选择优质一级、二级种苗移栽;不达标的小苗进行移床，生长1年后再用。