1.苗期管理
苜蓿在苗期最容易受杂草危害，尤其是在播种当年，不论春播、夏播还是秋播，首要的管理措施是清除杂草，减少竞争，为苜蓿幼苗的生长创造良好的条件。苗期的杂草防除最好以人工拔除，但如果面积过大，可以考虑使用除草剂，但一定要慎之又慎，以免对苜蓿幼苗造成伤害。
在气候寒冷的北方地区，如甘肃、青海、黑龙江、吉林等省，苜蓿的苗期管理除防除杂草以外，还应注意播种当年幼苗的越冬问题，具体应采取一些防冻措施，如培土或加其他覆盖物。
2.中耕除草
中耕除草是苜蓿田间管理的一项基本措施，目的是在苜蓿的生育期间消灭田间杂草，减少竞争，使之正常生长发育；通过中耕，对干燥的土壤，可以起到松土保墒作用，而对较湿重的土壤，则可以加速土壤表层水分的蒸发，也就是说中耕是调节土壤表层物理状况的重要措施。杂草对苜蓿的危害有两个较为严重的时期，一个是在幼苗期，特别是春播和夏播苜蓿；另一个是在夏季收割以后，这个时期由于水热同步，杂草生长异常迅猛，影响苜蓿生长，也给苜蓿草的质量带来影响。因此在杂草危害较猖獗时，要及时消灭，为苜蓿生长创造一个良好的生长环境。
中耕除草的方法应视具体情况而定，小规模的农户种植，可采用人工除草。而规模化种植苜蓿，靠人工很难达到预期效果，最好采用中耕机械。一年以上的苜蓿草地，在早春返青时应该进行耙地灭草，实际上，每次刈割以后，都应进行中耕除草。